VARIASI GENETIK SAPI BALI (BOS SONDAICUS) BERDASARKAN GEN SRY DENGAN MENGGUNAKAN METODE SEQUENSING

Abstract

Sapi Bali (Bos sondaicus) merupakan sapi asli Indonesia yang perlu dipertahankan kelestarian dan kemurniannya. Salah satunya dengan mengetahui keragaman genetik sapi Bali berdasarkan gen SRY. Tujuan penelitianialahmengetahuivariasigenetikdanhubungankekerabatan sapi Bali berdasarkan gen SRY dengan metode sequencing. Penelitian ini dilakukan dengan analisis secara deskriptif. Data genetik diperoleh dari hasil sekuensing, dianalisis menggunakan software Bioedit dan MEGA Ver.4 untuk mengetahui variasi, jarak genetik dan membentuk pohon phylogeny. Pengembangan multimedia interaktif mengadopsi model pengembangan ADDIE yang dimodifikasi peneliti hingga tahap uji coba validasi oleh para ahli. Hasil penelitian menunjukkan terdapat perbedaan urutan nukleotida yang merupakan substitusi dasar penyebab transisi, tranversi, insersi/delesi. Total transisi 9 nt, tranversi 15 nt, insersi/delesi 79 nt. Untuk merekontruksi hubungan genetik digunakan metode UPGMA dan terjadi 6 pengelompokan, kel.1 (bootstrap 87%) yaitu BB1, BB4, BB5 dan BS9. Kel.2 (bootstrap 69%) yaitu BB2, BB8 dan BS7. Kel.3 (bootstrap 67%) yaitu BB12, BB7, BB9 dan BS4. Kel.4 (bootstrap 66%) yaitu BS1, BS2, BS5, BB6 dan BB10. Kel.5 (bootstrap 52%) yaitu BS6. Kel.6 (bootstrap 50%) yaitu BS4, BB7 dan BB9. Jarak genetik terjauh (0,31) teridentifikasi pada BB1 dengan BB6, jarak terdekat (0,03) teridentifikasi pada BS5 dengan BS2, BB7 dengan BS4, BB9 dengan BB7, BB7 dengan BB12.
Kata kunci: Variasi Genetik, Sapi Bali (Bos sondaicus), Gen SRY,